Tout comme les deux côtés du Pont, entraînement et audition, fournissent une voie soigneusement tracée, étape par étape, consistant en niveaux de plus en plus élevés vers la liberté spirituelle, il en est de même des organisations ecclésiastiques de la religion de Scientologie, dont la structure hiérarchique reflète ces niveaux. Aux premiers niveaux de cette hiérarchie on trouve les ministres qui œuvrent au cœur de la société, ainsi que les groupes et les missions de lÉglise qui fournissent des cours et de laudition dintroduction ; aux niveaux supérieurs, on trouve de plus grandes Églises qui fournissent des niveaux daudition et des services de formation religieuse avancés.
Un système de management international a été établi pour diriger toutes les Églises, les soutenir, coordonner leurs activités et apporter son assistance afin de sassurer que la philosophie et les technologies mentale et spirituelle de la Dianétique et de la Scientologie développées par Ron Hubbard sont à la disposition de toutes les personnes qui souhaitent les recevoir et que les services de Scientologie sont appliqués avec précision, tels que Ron Hubbard les a présentés.
Il est bon de souligner, à titre dinformation, que chaque Église de Scientologie a été constituée comme une association à part entière, indépendamment des autres Églises ; elle possède son propre conseil dadministration, et ses cadres sont responsables des activités et de la prospérité de leur Église, en tant quassociation et en tant que corps ecclésiastique. Ces Églises forment entre elles un large réseau international composé de 5 000 Églises, missions et groupes. Plus de 22 000 scientologues dans le monde entier fournissent les services de la religion de Scientologie à titre de permanents dÉglises, de missions, de groupes et dorganisations.